生命情報解析学テキスト

現在学部生に行っている講義，生命情報解析学のテキスト資料を公開します．

まだまだ未完成なところや勘違い・間違いなどあるかと思いますが，バイオインフォマティクス，遺伝学，ゲノム科学などの基本的なところから勉強を始めるために，少しは役立つのではないかと思います．実際の授業ではこの半分以下しか教えられていません．

こういったものはいつまでたっても未完成なので，とりあえず前半部分を公開します．前半部分が基礎的な内容になり，後半がより応用的な内容になっています．インターネットで公開するにあたっては，図版の著作権が重要になってきますので，フリーライセンスまたは再配布が許可されたものだけを使っているつもりですが，お気づきの点があれば指摘いただければと思います．

PDFファイルはこちらのページで公開しています．

A generalized linear model for decomposing genetic, parent-of-origin, and maternal effects on allele-specific gene expression

今年修士を卒業した高田君が行った仕事がG3誌で公開されました．

A generalized linear model for decomposing genetic, parent-of-origin, and maternal effects on allele-specific gene expression

Reciprocal cross（正逆交雑）された個体間のアリル特異的遺伝子発現をみることにより，ゲノムインプリンティングによる遺伝子発現への効果を検証する研究が行われてきましたが，本研究ではそれに加えて，cis制御による変異の効果と母親の遺伝子型の違いによる母系効果を同時に推定する方法を考えたというものです．

G3誌はGenetics誌を発行するアメリカ遺伝学会が発行しているもので，PLOS ONEなどと同じく，メガジャーナルと呼ばれるものの一つです．